Що таке 3 5 фосфодіефірний зв’язок у РНК?
Фосфодіефірний кістяк ДНК і РНК. Зокрема, це фосфодіефірні зв’язки, зв'язують 3'-атом вуглецю однієї молекули цукру і 5'-атом вуглецю іншої (звідси назва 3', 5' фосфодіефірний зв'язок, який використовується для позначення такого типу зв'язку в ланцюгах ДНК і РНК).
Фосфодіефірний зв’язок – це зв'язок, у якому 3'-фосфатна група нуклеозиду з'єднана з 5'-гідроксильною групою іншого нуклеозиду. Напрямок завжди від 3' до 5' в нуклеотидах. Q. ДНК – це полімер нуклеотидів, які з'єднані один з одним 3-5 фосфодіефірним зв'язком.
У ДНК або РНК існують фосфодіефірні зв’язки зв’язки між фосфатною групою і молекулами цукру. ДНК містить азотисті основи (аденін, гуанін, цитозин, тимін або урацил, якщо це РНК), молекулу цукру (дезоксирибозу, якщо ДНК або рибозу, якщо РНК), і трифосфатну групу (рис. 1).
Отже, 3'-5' фосфодіефірні зв'язки всередині полінуклеотидного ланцюга служать для з'єднання один нуклеотид з іншим нуклеотидом. Нуклеїнові кислоти – це полінуклеотиди, тобто полімерні сполуки нуклеотидів.
Виникають фосфодіефірні зв’язки в ДНК між 3' і 5' гідроксильними групами на дезоксирибозі. (Це пов’язано із спрямованістю ДНК від 5’ до 3’, оскільки ДНК-полімераза може синтезувати ДНК лише шляхом додавання нуклеотидів до 3’-гідроксильної групи).
Якщо ви спробуєте приєднати 3'ОН-групу dNTP до 5'-фосфату наступного нуклеотиду, не буде достатньо енергії, щоб послабити зв'язок між киснем, з'єднаним з 5' фосфором (інші два фосфати dNTP знаходяться на 5'-кінці, а не на 3'-кінці), що ускладнює нуклеофільну атаку.